生物学用教材(はじめての染色体) / Group of Nuclear Genomics

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 このページでは、中学校、高校、大学の生物学の授業で教材として使用可能な植物の染色体構造やエピジェネティクスに関する画像、動画、実験プロトコルなどを紹介していきます。もちろん、すべて無料で閲覧、ダウンロード、使用することができます。電子書籍(お試し版を除く)については、2次配布せずに、こちらのサイトからダウンロードをお願いします。動画ファイルをDVDに焼いて授業で使用するのは問題ありません。


・夏の高校生向け科学実験イベント(SSS 2016)
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9のコースに分かれて、「植物研の研究」を体験できます!!
もちろん「はじめての染色体」的コースもあります。

・はじめての染色体〜染色体写真集&実験マニュアル〜

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 PLOS ONE(2012年12月7日号)LinkIconで発表した研究結果(タマネギの細胞分裂の3D詳細解析)を中心とした私たちの成果に基づいた電子書籍です。最新の3D解析データー画像に加えてインタラクティブな3Dモデルなども多数掲載しており、生物の副教材としてもご利用いただけるかと思います。この教材には、iPad用のiBooks版、インターネット用のブラウザーでも閲覧可能なWeb版、および動画は動かないけれどオフラインで使えて汎用性もあるPDF版があります。
 iPad用のiBooks版では、インタラクティブに学習することができます。できるだけ鮮明な画像をお届けするために高解像度画像を使用していますので、iPadのバージョンによっては読み込みに時間がかかるる場合があります。こちらのテストではiPad2以降の機種(iPad2、第3世代、第4世代、iPad mini)では快適に利用できました。また、初代iPadでも3Dモデルの表示に3秒程度かかる場合もありましたが、作動はしました。残念ながら、Appleの仕様で「インタラクティブなiBooksファイル」は、iPhoneおよびiPod touchでは作動しません。
 Web版は、iBooks版をWebで試用できるようにダウンコンバートしたものであり、iBooks版と比較して機能が縮小されている部分があります(インタラクティブなことができません)。PDFは印刷用のフォーマットなので、PDF版では動画や3Dモデルは動きません。

*「指導者用のデジタル教材」等としてコンピューターを用いてフルサイズの動画を表示する必要がある方は、PLOS ONEの論文LinkIconのFigure S3(間期)、Figure S4(前期)、Figure S6(中期)、Figure S7(後期)、Figure S8(終期)、Figure S9(後終期)をご利用ください。「Supporting Information」の部分に上記の動画へのリンクがあります。PLOS ONEは、どなたでも無料で閲覧可能です。

はじめての染色体 for iPad & OS X Mavericks iBooks (おためし版)
(OS X MavericksにiBooksが登場!これからは、Macでも「はじめての染色体」が読めます!)
LinkIconはじめての染色体(iPad用iBooksおためし版)をダウンロード(20.3 MB)

はじめての染色体 for iPad & OS X Mavericks iBooks
(Ver. 1.07)
(日本語版の英語版相当品です。「とにかく軽く!」という方はコチラをどうぞ!)
LinkIconはじめての染色体(iPad用iBooks版 ver. 1.07)をダウンロード(79.6 MB)
iPadで直接ダウンロードするか、コンピューターでダウンロードした後にiTunesを使ってiPadに転送してください。iOS App iBooksを使用して読むことができます。(「おためし版」を使用した後に、こちらをダウンロードするときは、先にiBooksの「ライブラリ」画面から「編集」を選び「おためし版」を削除してください)

はじめての染色体 for iPad & OS X Mavericks iBooks (Apple ver. 1)
(OS X MavericksにiBooksが登場!これからは、Macでも「はじめての染色体」が読めます!)
ついに、日本語版の最新版がiBookstoreにデビューしました。
LinkIcon

Apple beta5 ver.からの変更点
細胞分裂の仕組みを学べるパラパラ漫画「ぬっく3兄妹と学ぶ、細胞のスゴ技(最終回)」を追加しました。
パラパラ漫画風「植物の細胞分裂〜まとめ〜」を追加しました。

Apple beta4 ver.からの変更点
・細胞分裂の仕組みを学べるパラパラ漫画「ぬっく3兄妹と学ぶ、細胞のスゴ技〜第2話〜」を追加しました。

Apple beta3 ver.からの変更点
・Web検索で「染色 原理」の検索キーワードで訪問する方が多かったので、「ふろく〜染色体実験豆知識〜」を加えました

Apple beta2 ver.からの変更点
・「連続写真1.5」のタイトルがおかしかったので修正しました。

Apple beta ver.からの変更点
・図の順番がおかしかったので修正しました。

Ver. 1.07からの変更点
・各細胞周期で見られる構造の「インタラクティブな説明図」を追加しました。
・細胞分裂の仕組みを学べるパラパラ漫画「ぬっく3兄妹と学ぶ、細胞のスゴ技」を追加しました。
・「細胞分裂〜終期〜」に含まれていた「後終期」を独立させました。
・「オープニング動画」が変更されました。

↓iPad用iBooks版デモビデオ
(ご覧になるためにはQuickTime Playerが必要です。→LinkIcon


はじめての染色体 (Web版)
LinkIconはじめての染色体(Web版 ver. 1.08)を開く
Web用のブラウザーで、そのまま御覧になれます。
(ページ内の動画をご覧になるためにはQuickTime Playerが必要です。→LinkIcon

はじめての染色体 (Web LiVE版)
LinkIconはじめての染色体(Web LiVE版 Apple beta5 ver)を開く
Web用のブラウザーで、そのまま御覧になれます。
(Web LiVE版は、Web版のハイクオリティーバージョンです。)

はじめての染色体 (Web LiVE版 for iPhone 5, 5s & 5c)
(iPhone5、5s、5cに限らず横長のモニターをもつデバイスに対応)
LinkIconはじめての染色体(Web LiVE版 for iPhone 5, Apple beta5 ver)を開く
このバージョンはiPhone5、5s、5cやiPod touch 5thなどの横長のモニター(いわゆる16:9のHD)に最適化してあります。

はじめての染色体 (PDF版)
LinkIconはじめての染色体(PDF版 Apple beta4 ver)をダウンロード(31.1 MB)
PDFフォーマットですので多くの電子書籍リーダーやコンピューター、タブレット、スマートフォンでiPadに表示されるものに近い形で御覧になれます。また、Web版とは異なり、オフラインでも利用できます。ただし、「連続写真」や「3Dモデル」は動きません。連続写真の一部については、上記「指導者用のデジタル教材」のところで説明してある、PLOS ONEの論文LinkIconのFigure S3&4、S6〜9の動画をあらかじめダウンロードしておけば、iPad以外の端末でもiPad版に近い品質で利用することができます(動画に未対応の端末は除く)

はじめての染色体 nano (PDF版、折りたたみハンドブック)
LinkIconはじめての染色体 nano をダウンロード(36 MB)
両面印刷して折りたたむとハンドブックができあがります。軽い気持ちで作りましたが、けっこう便利かも。

参考論文
1. Nagaki K, Yamamoto M, Yamaji N, Mukai Y, Murata M (2012) Chromosome dynamics visualized with an anti-centromeric histone H3 antibody in Allium. PLOS ONE 7(12): e51315.LinkIcon

2. Nagaki K, Kashihara K, Murata M (2005) Visualization of diffuse centromeres with centromere-specific histone H3 in the holocentric plant Luzula nivea. Plant Cell 17: 1886-1893.LinkIcon

3. Nagaki K, Cheng Z, Ouyang S, Talbert PB, Kim M, et al. (2004) Sequencing of a rice centromere uncovers active genes. Nature Genetics 36: 138-145.LinkIcon

4. Yamaji N, Ma JF (2007) Spatial distribution and temporal variation of the rice silicon transporter Lsi1. Plant Physiol 143: 1306-1313.LinkIcon

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